外周血淋巴细胞分离+RNA提取心得分享(附大量实图)
实验菜鸟一只,历经了大半年的折腾,试验了N多方法,浪费了无数实验材料和患者标本,挨了不少导师的骂,总算是比较顺利地解决了从外周血分离淋巴细胞+RNA提取的问题,以下是个人心得体会及结果,分享给大家
主要试剂/材料选择:
1.人外周血淋巴细胞分离液:这个比较容易买到,也很便宜,国产的就可以,我用的天津XX公司的,保存时注意避强光及紫外线;操作时注意无菌操作,以免污染;
2.trizol:这个也比较容易买到,不过牌子五花八门,大家就仁者见仁智者见智了
3.其他:氯仿、异丙醇、无水乙醇,无酶水,15ml无菌离心管(买成品),大中小无酶*头(买成品),1.5ml无酶EP管(买成品)。电泳:TAE电泳液,琼脂糖粉,goldview II型染料,DNA marker(可有可无),DNA loading buffer,ddH2O
有两点值得一提:
一是最好不用反复使用的玻璃器皿,直接用一次性的塑料器皿即可,直接买
另一个是关于DEPC无酶化处理,因为DEPC具有一定毒性,且处理较复杂,所以我没有买,实验操作是在超净台内进行,只要动作迅速准确,器材不反复使用,一般来说提取的RNA质量还是比较好的。电泳相关设备的话也是一样,我只是单纯地拿酒精泡了泡,然后放37℃孵箱烘干即可
一. 外周血淋巴细胞分离:
1.紫头管(EDTA抗凝)采集2ml抗凝血,尽快运送至实验室进行后续步骤
2.取一支15ml离心管,加入3ml分离液
3.用移液*小心吸取血液样本加于分离液的液面上,如下图
4.500g离心20min。离心后,此时离心管中由上至下分为4层,第一层为血浆层(黄色),第二层为环状乳白色淋巴细胞层(图上不是很清楚),第三层为透明分离液层,第四层为红细胞层,如下图(拍的时候没注意虚焦了。。。),第二层就是我们要的东西
5.用移液*(1000ul*,调整量程至500ul)小心吸取第二层环状乳白色淋巴细胞层到另一15ml离心管中(*头悬于淋巴细胞层上方1-2mm即可开始吸,一边吸一边水平移动*头,大概需要吸3-4次才能基本上吸完),向所得离心管中加入10ml PBS,混匀细胞
6.250g离心10min,弃去上清
7.以5ml PBS重悬所得细胞
8.250g离心10min,弃去上清(必要时重复步骤7,8,就是再洗一遍)
9.以0.5ml PBS重悬细胞(这一步最好不加,否则1ml trizol+0.5ml PBS+0.2ml氯仿=1.7ml液体体积,后续步骤无法用1.5ml的EP管完成。当然,这里提的淋巴细胞可以用于其他细胞实验)
二. Trizol法提取总RNA
1.向所得淋巴细胞中(直接在15ml离心管里)加入1ml trizol,vortex震荡几秒混匀,室温静置10min
2.将液体转入一个1.5ml EP管中,加入氯仿200ul,握住EP管上下大力摇晃15s,此时溶液应为粉红色的浑浊液体,室温静置3min
3.4℃ 12000rpm 10min
4.小心转移上层400ul水相至新EP管(中号*头,吸的时候*头随着液面往下移动,切勿吸到中间层白色物质);加入600ul异丙醇上下颠倒摇匀,室温静置10min
5. 4℃ 12000rpm 10min,擦干净管壁的水雾后,管底可见一小片白色片状沉淀,一般是在管底或者邻近的侧壁,如下图:
6.小心倒掉上清,加入1ml 75%乙醇(新鲜配置,750ul无水乙醇+250ul无酶水,加入75%乙醇后沉淀会更清晰),轻摇EP管或手指弹管壁,要让沉淀浮起来在酒精里洗澡
7.4℃ 7500rpm 5min
8.小心倒掉上清,以小*头小心吸掉沉淀周围大部分残留液体,室温下适度干燥沉淀,待沉淀开始变透明时(不要等到彻底变透明),立即30-50ul 65℃预热无酶水溶解
结果:
浓度=414.6ng/ul
260:280=1.94
260:230=2.18
三. 琼脂糖凝胶电泳:
开始的时候我没有跑电泳,PCR的结果一直不理想,和ELISA的结果相反。。。后来跑了电泳才知道自己提的RNA质量太差,导致PCR结果不可信。后来提取RNA质量稳定后的PCR就和ELISA结果一致了,所以建议大家每次提取RNA后不要嫌麻烦,都跑电泳看看RNA质量是否合格,如果不合格,建议这个标本不要做PCR,直接丢弃
步骤:
1. 取4ml 50×TAE,加入196ml ddH2O制成1×TAE(制备量根据电泳槽的大小决定,我的电泳槽比较小,不到200ml就满了)
2. 称取0.2g琼脂糖,加入20ml 1×TAE,加热至琼脂糖完全溶解(凝胶浓度为1%,厚度建议在5mm左右,可以量一下模具的大小,简单计算一下;微波炉加热高火1分钟左右,一定要像烧开水一样完全沸腾,否则凝胶会花)
3. 待凝胶液体自然冷却至不烫手后,加入2ul Goldview,混匀后将溶液倒入模具,插入梳子,放4℃里等待凝固成型后,拔出梳子,放入电泳槽,倒入电泳液至淹没凝胶(千万不要把凝胶放反了!反向电泳意味着白给)
4. 取出RNA样品5ul,加入1ul的6×loading buffer,混匀后立即点样至凝胶中
5. 将5ul marker(D2000 plus DNA ladder)点样至凝胶中(RNA电泳的话,marker其实也可以不加,只是加了之后方便看各个RNA条带的大致位置,当然大神的话一般是不加的)
6. 上机电泳(120V,时间15min,不建议电压太高,凝胶会显著发热甚至烫手,高温会降解部分RNA)
可见清晰的28s、18s和5s条带,其中28s:18s约等于2:1,证明提取的RNA质量良好,可用于后续实验(手机拍摄,28s条带上下有点糊。。。但是在电脑上看就没有)
以上就是提取外周血淋巴细胞总RNA的心得分享,欢迎大家交流学习!
最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 1.4 万