微生态菌群概述及研究策略

       1958 年的诺贝尔奖获得者里德伯格指出，人体是一个由人的细胞和所有共生。 微生物的细胞构成的“超级生物体”，正常人体的细胞数量为10万亿，而寄居在人体的微生物数量高达 100 万亿个。人体微生态系统主要分为以下几大类：口腔微生态系统、胃肠道微生态系统、泌尿道微生态系统、生殖道微生态系统、皮肤微生态系统和呼吸道微生态系统。各系统微生物总重量相当于肝脏的重量，其中肠道微生物占到约 78%。与人体共生的微生物并非现代的产物，早在人类出现时这些微生物就与人类共同生活、进化至今。正常的菌群具有促进人体营养吸收、合成维生素、调节免疫等功能；而菌群的失调则可能导致牙周炎、代谢性疾病、癌症、心血管疾病、精神类疾病等等。因此，菌群与疾病和健康的研究在医疗领域获得广泛关注。

目前微生态的研究主要有微生物多样性和宏基因组两大策略：

一，微生物多样性测序（又称扩增子测序），是通过对细菌 16S rDNA 的特定区段进行 PCR 扩增并利用 Illunima Miseq 2*300bp 平台完成 DNA 测序，分析获得各环境样品中微生物的结构组成及丰度信息。该技术不仅突破了多数传统微生物不可培养的缺点，而且大大提升了测序通量，降低了测序成本。

微生物多样性服务流程：测序及分析

二，宏基因组测序是指通过高通量测序平台对环境样品中所有微生物的基因组进行测序，分析特定环境中微生物群的多样性与丰度、微生物群体基因组成及功能，进而分析微生物与环境、微生物与宿主代谢之间的关系，发现具有特定功能的基因。宏基因组测序无需分离培养微生物，较大扩展了微生物资源的利用，为微生物群落的研究提供了有效工具。宏基因组测序可以探索和估计样本中真实的物种多样性和遗传多样性，更全面地揭示微生物的物种组成、功能基因及代谢通路方面的信息。

 宏基因组服务流程：测序及分析

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