请教个结核感染巨噬细胞相关问题

我想做巨噬细胞对结核菌杀菌作用的实验，一般是感染结核菌，用阿米卡星杀灭胞外结核，然后培养一段时间裂解细胞，对裂解液进行菌落计数。但有一个问题是如何保证在初始状态下细胞的含菌量是基本一致的呢？如果某种刺激促使巨噬细胞吞噬功能增强，那么如何判断最后菌落计数增加是因为吞噬增强了，还是杀菌能力弱了？谢谢。