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关于提取百日咳杆菌RNA检测百日咳杆菌

医疗行业从业者 · 最后编辑于 2022-10-09 · IP 重庆重庆
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这个帖子发布于 8 年零 144 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

新手求教。

目前市面上有很多试剂盒可以提取百日咳杆菌DNA检测百日咳。多是根据百日咳杆菌插入序列IS481为靶区域,设计特异引物和探针。

我有个新课题是提取百日咳杆菌RNA来检测百日咳杆菌。我咨询了一下,通过RNA检测,只是需要在PCR反应液中加入逆转录酶即可,而设计百日咳杆菌插入序列IS481的特异引物和探针遇到了困难。

首先通过NCBI直接搜索白日杆菌插入序列IS481,结果出来很多, 有点不知道选择哪一个,界面如下

img

img

查阅的文献资料上引物在NCBI 上无法BLAST,出来的界面如下。

img

然后自己通过NCBI直接设计引物依然不行,界面如下

img

最后就自己通过Primer5.0设计引物。


求大神帮我看看,我以上的思考方法是对的方向么?

我通过Primer5.0设计出了引物,NCBI无法BLAST,那我该这么确认我设计出的百日咳IS481序列的特异性呢?

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