image J 测心肌细胞大小

第一次用image J 测量心肌细胞大小,自己摸索走了弯路,写出来供靠自己摸索的小白参考,也欢迎纠错。
1.测量心肌细胞大小需要先在显微镜下摄片,要注意观测倍数是“物镜的倍数乘以目镜的倍数”,而不仅仅是物镜的倍数。下图就是物镜,当用20x观测时,实际是20x10=200倍,因为该显微镜的目镜倍数为10。
2.要拍出能在image J软件下能够很好的测量大小的照片,注意要拍横截面的图片,不要拍纵切面的图片。下图一是横截面,图二是纵断面。图二没法用来勾勒边界。
3.我拍的照片当时电脑上没有bar,后期自己回来添加,可以用PPT做。
4.在image J软件中选择open,打开需要处理的图片后,首先要计算bar的像素大小。
(图一)先点击红箭头所示的直线工具,(图二)在图片中按照bar的长度照着画一条直线(黄线所示),(图三)画完直线后点击Analyza下拉菜单中的Measure.(图四)结果出现result框。
5.接下来设置比例尺。"Distance in pixels"是“距离用像素表示是多少”,上一步已经由软件测算出来是623;"Known distance"表明“这个距离相当于多少的实际距离“,在上一步骤中测量的线段长度(即bar的长度)实际值为200μm,因此此处填200;“Pixel aspect ratio”是指“像素的宽高比”,默认1,具体比值可以通过"ImageJ->Properties"来查看;Unit of length:单位长度的像素是多少,此处写μm。
6. 设置完毕后开始测量
点击下图的心形,接下来就可以在图片上圈定细胞边界,画好边界后同样在analyze下选择Measure,在result里面便可看到测算出的面积。
7.收集好数据便可开始统计了