由于最近在做某基因表达与预后相关性的分析,对如何选择最佳cutoff值很疑惑。搜了丁香园的各大帖子,发现对x-tile如何使用并没有人分享过。经过对照软件中的操作说明,终于搞明白是怎么回事了,现分享给大家!
首先,将你excel表格中的“某基因的表达值”“总生存期”“删失情况”等等其他一些数据复制到文本文档中。注意:“删失情况”要写成“censored”, “uncensored”, or “unknown” 形式。
然后打开软件(软件下载见附件),如图
点击“Analyze
天呐!太卡了......
余下的步骤见附件1,软件下载见附件2