Imagej软件进行Sholl analysis
发布于 2016-07-27 · 浏览 2.6 万 · IP 湖北湖北
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Imagej 是生物医学图像处理的开源处理软件。Sholl analysis 是在神经元的研究中通常来表征被成像神经元形态特征的定量分析方法。下图是来自最新发表的Natural Communication 上的Figure：即用ImageJ软件对神经元复杂性进行了定量分析。
首先下载最新版本的Imagej：
打开一张Map2 标记的神经元图片：
调节对比度：
Plugin->Segmentation->Simple neurite tracing, tracing,再做 Sholl analysis
Simple Neurite Tracer (SNT)
最后编辑于 2016-07-28 · 浏览 2.6 万
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