关于LC3II 及AB的问题和我得到的信息
如题,做自噬的western时候考虑用LC3座检测指标,想通过LC3I/II的比值看自噬,但在试剂订购过程中发现LC3抗体存在A A/B两种,查阅之后发现,哺乳动物中有三种LC3,包括LC3A、LC3B和LC3C,它们在自噬过程中存在相关的翻译后修饰。LC3蛋白首先会在合成后立即在其羧基端被Atg4所剪切,产生细胞浆定位的LC3-I。在自噬过程中,LC3-I会被包括Atg7和Atg3在内的泛素样体系所修饰和加工,产生分子量为14kD的LC3-II,并定位到自噬小体中。这样,自噬小体中存在的LC3,和低分子量的LC3-II都被当做细胞发生自噬的分子标志(autophagy marker),并且LC3-II的含量和发生自噬的程度成正比。LC3B作为LC3的一种,同样可以用作自噬的分子标志。
然后呢,基本上大家做western自噬检测LC3选择LC3B就差不多了。
LC3B抗体识别的是总LC3B (total LC3B),可以检测内源性的LC3B,可以同时识别LC3B-I和LC3B-II,分子量依次分 别为16 kD和14 kD
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那么小弟的问题就是,是不是经过二抗孵育显影之后,片子相当于16和14kd的位置上上会出现两条条带,分别是LC3B-I和LC3B-II?这两个分子量大小相差这么大在胶片上真的能区分开吗?
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再一个问题就是关于marker的问题,由于想要节省经费,我选择用非预染的marker,但是非预染的marker是不是应该在跑胶之后单独切下marker的跑道,单独进行染色和脱色备用啊?然后再根据marker显色的条带和目的蛋白分子大小,判定目的蛋白的情况和决定切胶时留取哪一部分。
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还有一个问题,就是marker是不是买的时候就含有上样缓冲液,上样的时候不用再加了?
最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 2.8 万