【求助】提取细菌RNA有DNA污染怎么办

最近一直提取细菌RNA，想做qRT-PCR，是新手，多次用promega试剂盒进行提取RNA，每次都有DNA污染，求助啊~~
1.用未逆转录的RNA进行电泳，有些样品23S上方还是依稀看到有条带的。（时间紧急忘记加marker)

2.用未逆转录的RNA进行PCR，结果都有阳性条带；
3.用未逆转录的RNA进行qPCR, 取RNA 0.5ul上样，体系20ul，结果CT 都是15-30之间。本以为是痕量DNA不会太大影响结果，看到CT值，感觉DNA污染太严重了，让我更加不敢用了。

我看到很多帖子有下面2种方法解决：
1.设计引物跨越内含子设计，但是原核生物基因组DNA也没有内含子，就无法通过设计引物来避免基因组DNA影响qPCR结果；
2.将提取的RNA最后再用DNA酶处理，然后用EDTA灭活DNA酶，或者是酚氯仿抽提，但是大多会说最后逆转录都没有条带出来了，或者RNA得率很低。
我尝试用promega提取RNA试剂盒重新将提取的RNA再次进行DNA酶处理，以及后面的RNA洗液步骤，最后出来的结果是：
再次提取的RNA电泳看不到任何条带；
再次提取的RNA直接进行pcr有阳性条带；
同时将再次提取的RNA、以及逆转录后的cDNA分别进行qPCR 两者CT值很贴近，都是20-25范围内。
看到这样的结果我泪奔了······
毕业将近，时间紧迫，问题困扰了好久不知如何解决，求助园子里高手，有没有好的办法提取原核生物的RNA。小女子在这里谢过了~~