【求助】关于有假基因的基因测序的问题

我有一个基因，他附近有很多假基因，而且相似度很高，同源性几乎95%以上，请问我这序列该怎么测序呢，引物怎么设计啊？测出来的序列不会是重叠序列吧？请高手帮忙分析分析，谢谢了。