【求助】GFP融合蛋白WB只检测到GFP条带

我在做GFP融合蛋白时，用GFP抗体western blot检测时遇到这样的问题：只见到GFP条带，见不到分子量大的融合蛋白带。是在N端融合GFP的，GFP与目的蛋白之间的linker我设计得比较长，且有两种长度（WB条带应该是有差别的），但检测到的条带都是一样大的。克隆的融合质粒送测序是对的。由于目的蛋白的抗体不好不能做WB，但我可以用别的方法检测到我的融合的蛋白还具有一定目的蛋白的功能。我现在不明白是怎么回事，请各位老师，战友帮我分析分析，感谢！