【求助】关于扩增曲线和溶解曲线，求大神解释，一直困扰我的两个问题

背景：体系比较独特，也许就是问题的根源吧。
废话不说先
模板：小鼠尾gDNA 200ng/2ul
酶：天根taq PCR masterMix（普通酶，不含荧光染料） 10ul
染料：Eva Green（一种类似SYBR I的染料） 1ul
引物：目的/内参 5uM/1ul
刀刀水 6ul total 20ul
条件：90℃ 30s 1cycle；90℃ 30s，60℃ 30s，72℃30s，35cycles，melt curve, Default
PCR管：Bioplastics96孔板 仪器：ABI7500
体系配置流程：先依次加gDNA模板，然后将剩余组分预先混匀，再依次每孔加18ul预混液。
加样流程：gDNA模板全部加完后，依次加入两种预混液（分别含不同引物）。一般上下两排作为目的/内参一组，即是加完第一排目的基因的预混液，然后第二排加内参基因的预混液，后面依次轮流。PCR开始前离心5min去除气泡。

问题来了，
问题一：大部分孔起峰早，导致Ct值很低；详情见图

（A图是所用孔的扩增曲线，B、C、D分别是第1和2、3和4、5和6排的扩增曲线）
问题详细：由图中可见大部分孔第二个循环就起峰，信号一直持续而且相当高，对Ct值得影响相当大。不是知否PCR体系的原因导致，还是其他，求各位大神指点。

问题二：同样是扩增曲线的问题，一般情况是目的/内参两个基因的阈值大致相等，而我的却相差很多，这一现象是否也是由起峰早引起的？见下图

起峰早严重影响了Ct值得大小，使得结果无法判断，请大神们指点迷津。

问题三：关于溶解曲线，虽然目前看来不影响结果判断，但也想把原因搞清楚。
如图：

问题详细：由图可见，先加预混液的第1、第2排的溶解曲线明显没有后加的（3、4排）高。而且每次都是第1排最低，其次是第2排，而第3排和第4排高度又差不多了。目的基因和内参基因都是如此。
想请教峰的高低表示pcr扩增后的产量吗？（这个问题比较小白）是否加样顺序影响了峰的高低？大神们有没有遇到这种情况？

PS：问题有点长，谢谢大家耐心看完！欢迎提出宝贵意见！