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GEO数据库的使用方法,边学边问,有图有真像

肿瘤内科医师 · 最后编辑于 2022-10-09 · IP 广东广东
8.9 万 浏览
这个帖子发布于 14 年零 166 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
关于GEO数据库的使用的疑问
1.我是通过下面的路径开始GEO数据库的检索的
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gds
输入关键词 metastasis and human 后 ,出现的结果
img

2.从中选择自己感兴趣的
img


以上图片中,我自己的理解是:开头的GDS2527 代表GEO数据库的序列号
GPL93 是关于用于以高通量方式检查样本的物理试剂的信息,主要是指芯片的类型,与一个提交者,许多样本有关。
GSE6919,书上说这是样本收集,样本是如何相关的,如何排序的,分析是如何进行的,这个不太明白,我点进去后,出现下面的画面
img


搞明白了些,就是一系列相关样本的芯片信息
在页面的最下面,出现个下载连接
img

这是整个这个系列的所有的芯片信息么?
下载的芯片信息是什么样子的呢?谁能给出的图例呢?

我比较关心的是GSE6605和ESE6606,点GSE6605后,出现下面的画面
img




















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