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【原创】用NTSys pc做PCA

发布于 2010-11-07 · 浏览 4446 · IP 北京北京
这个帖子发布于 14 年零 190 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
最近由于写论文的关系需要用到NTSys 作图,在网上到处搜索本软件的教程都没有,大家千篇一律的都在用该软件做聚类分析,但是本软件做主成分分析(PCA)的非常少,就更别提主坐标分析(PCOA)了,好不容易在一个硕士论文中发现蛛丝马迹,然而本人愚钝,并没有完全参透,因此发上来供大家参考,大家群策群力共同解决该问题。
具体方法如下:
1、将原始矩阵用Standardization子程序进行标准化
2、将标准化后的矩阵用Similarity子程序中的Interval data求出变量的相关系数
3、再用Ordination中的Eigen子程序算出特征值(Eigenvalue)和特征向量(Eigenvector)
4、把特征值和特征向量用Project子程序投射到三维构象图上
5、最后用Mod3D子程序显示。即可得到主成分分析(PCA)的三维构想图
这是武汉植物园彭焱松的硕士论文中的方法,但是不够详细,还请各位同行补充细节!!






最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 4446

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