疑难病一例

病史特点：
⑴季某，男，18岁，学生；
⑵既往体健，发病前无“感冒、腹泻”史；
⑶主诉：意识不清三小时；
⑷现病史：患者于2004-06-13 04：00被家人发现昏迷在床，呼之不应，呼吸浅表不规则，时有停顿，伴间歇性四肢抽搐，全身发烫，当地医生测体温40℃，肌注“退热针”后送至我院，于急诊出现呼吸停止，气管插管后收入住院；
⑸查体：T 36.6℃,P 100bpm,BP 113/60mmHg,神志不清，压眶有反应，自主呼吸消失 ，气管插管人工气囊辅助呼吸，双侧瞳孔等大等圆，直径2mm，对光反射存在，可及眼球垂直震颤，颈有抵抗，两肺呼吸音稍粗，心率100次/分，律齐，无杂音，腹平软，肝脾肋下未及，四肢肌张力可，肌力无法检查，腹壁反射及提睾反射存在，双侧Babinski征及Gordon征阳性，其余病理征未引出，脑膜刺激征（-）；
⑹辅查：①血常规：WBC 17.5×109/L,N 0.80,L 0.17,RBC 4.06×1012/L,HGB 128g/L,PLT 143×109/L.
② 血电解质：K+ 5.48mmol/L,Na+ 141mmol/L,Cl- 96mmol/L,HCO3 -23mmol/L。
③血糖： 5.2mmol/L.
④CSF：无色透明，潘氏试验(-),GLU >2.8mmol/L,Pro 0.15g/L,Cl- 114mmol/L,WBC 6×106/L.
⑤血生化：AST 214IU/L,ALT 79IU/L,TP 74.1g/L,ALB 43.3g/L,A/G 1.4,TBIL 34.6υmmol/L,DBIL 4.7υmmol/L,BUN 6.21mmol,Cr 102υmmol/L.
⑥头颅CT：未见明显异常。
⑦心电图：未见异常。
诊断为“昏迷原因待查：脑干脑炎？”，入院后立即给予呼吸机辅助通气，静注甘露醇、地塞米松、阿昔洛韦、青霉素、胞二磷胆碱等治疗，于当天07:30神志转清，并渐渐恢复自主呼吸，于20:00脱机，鼻塞给氧2L/min,体温正常，之后患者一直无不适主诉，T、P、R、BP均正常，于06-15 15:00出院。
对此病人我有几点疑问：
⑴诊断脑干脑炎是否恰当？为什么恢复如此之快？脑干脑炎在CT上是否会有表现？
⑵ 患者当天上午神志清醒时，跟他讲话能点头摆手示意，但却没有规则自主呼吸，呼吸机必须以A/C+PEEP模式通气，即使改为SIMV模式也会窒息报警，直到晚间才恢复，为什么？
望各位大虾帮忙考虑，谢了！