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基因芯片之小白菜乐园 [精华]

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guanyuxia
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初来这里,嘿嘿,小白菜都够不上。芯片上应该有内标,可以根据内标确定你的表达丰度,做芯片扫描时用软件处理。1200个点里有这么多上调下调基因,你用的是哪的芯片,有没有质量控制啊,呵呵,灌水
2004-09-18 11:01
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guanyuxia
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Ratio值大于2和小于0.5的点才可以用,不过在芯片制作和杂交过程中,有许多不确定因素,这就要具体分析了
2004-09-18 11:08
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hangxuqun
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1.我有一个上海博星公司的genechip的最后结果,downregulation(cancer/cntrol)d的基因有42个,upregulation的gene有55个.我阅读了用该公司的结果发表的一些文章,虽然有启发.但分析这个具体问题,感到不好下手.我对对gene产物信息不很了解. 请问大侠们应该学习那些相关知识?
2.能否根据genechip中upregualtion的gene,从而确定哪些产物可作为cancer特异抗原(或者蛋白分子). 如果有这方面的文章,请问那位大侠可以提供文章或者出处.
谢谢!
2004-09-18 19:20
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  • 40楼
我不清楚"基因的功能要到国外的IMAGE网站上查",我分析的方法是在medline_nucleotide中输入gene号(如NM_005166,NM_005950等),可找到相应的说明和参考文献.但目前分析起来,很吃力,见上面的问题.
2004-09-18 19:40
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