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遗传发育

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论坛首页  >  遗传学与发育生物学讨论版   >  医学遗传学
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搞复杂疾病易感基因的请进！ [精华]

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楼主 houliping
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这个帖子发布于14年零220天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。
不知道国内搞复杂疾病易感基因研究的同道有多少。建议搞这方面的兄弟或姐妹一起交流交流。自己觉得很多东西都不太明白，国内又没有这方面的教材。

我先提几个问题，大家交流交流吧
1.连锁和关联研究的区别和联系。

2.连锁不平横的评价指标，及连锁不平衡和关联研究的关系。

3.单体型估计的常用方法。

4.tagSNP的选择标准，及常用方法。

5.复杂疾病研究常用的研究设计，及统计方法。

感兴趣的可以发帖讨论讨论。2005年LANCET上连续的七期刊登了遗传流行病学的系列文章。标题分别为：
1.Key concepts in genetic epidemiology
2.Genetic linkage studies
3.Genetic association studies
4.Shaking the tree mapping complex disease genes with linkage disequilibrium
5.What makes a good genetic association study
6.Population-based family studies in genetic epidemiology
7.Genetic epidemiology and public health hope, hype, and future prpspects

建议大家看看。
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2006-03-22 13:59 浏览 : 8328 回复 : 44
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crescent1999
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  • 2楼
我们现在正搞这样的课题,但是我是新手,上述一些问题也不是很清楚,希望高手们不吝赐教!
2006-03-22 15:50
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楼主 houliping
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  • 3楼
首先介绍连锁和连锁不平横的这两个最基本但又最重要的两个概念。两个位点从父代共遗传给子代的概率比按独立分配原则的概率高则称两个位点连锁。两个位点连锁不平衡则是指整个人群中两个位点处在同一个单体型的频率比期望值高。通常，如果两个位点连锁不平衡则两位点连锁，但是两个位点间存在连锁并不一定代表两位点间连锁不平衡。

连锁比连锁不平衡在染色体上延伸的区域要长。如果两个位点在减数分裂的过程中发生重组的概率小于50％则两个位点间连锁。但是，人群中两个位点间发生的每次重组都会削弱这两个位点间的连锁不平衡，仅当两个位点靠的非常近时连锁不平衡才能得以维持。
2006-03-24 14:45
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twer2003
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  • 4楼
连锁分析(1inkageanalysis)是基因定位中的主要策略之一。其基本原理是：在家系中，位于同一条染色体上的两个位点(致病基因与遗传标记)在减数分裂的过程中会发生交换与重组，染色体上的两个位点间相距越远，发生重组的机率越高，两个位点在一起传给后代的机会就越少。因此，由家系中标记位点与疾病位点间的重组率可估算出两者间的距离以及连锁程度。通过对覆盖密度适当的遗传图中的遗传标记(marker)在家系中进行分型(genotyping)，以此找到与致病基因紧密连锁的某一标记，从而确定该基因在染色体上的粗略位置，在此基础上再在该染色体区域使用覆盖程度更高的标记物作深入的连锁分析，就可将致病基因确定在较小的区域，这样，再利用物理图提供的该区域的染色体片段将基因确定或克隆。连锁分析中，家系提供的信息量主要取决于两个方面：①家系的结构及大小，如世代数、核心家系数及患者数等；②遗传标记物杂和度，高者信息量大。
连锁分析法主要适用于已知遗传方式的单基因遗传病的基因定位，而在多基因遗传病易感基因定位研究中的作用非常有限。其主要原因是：①多基因疾病的遗传没有一个固定的模式，无法设置参数并套用公式；②多基因遗传病一般发生率很高，使基因突变的机会大大增高，影响了基因定位时目的基因的确定；③多基因遗传病在不同家系中甚至在一个大家系中存在遗传异质性，使这些家系资料无法累加；④此外，有假阳性或假阴性出现。解决的方法是遗传模式一定要选正确，并重复已做的实验和分析。
2006-03-25 10:12
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