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蛋白质和糖学

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[话题讨论 2 ] 朊病毒 [精华]

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cloner
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icesugar75
Bonus Question: 有没有任何文献证实,分子量处于25KD 和37 KD 的prion 蛋白是具有感染性的蛋白质?---- 依提供文献和论证的有效性,加 2~5 分


谈一谈自己的看法,相关的和不相关的。prion 蛋白由254个氨基酸组成,其分子量应为26-27Kd,但由于prion的180位和196位有糖基化位点可被糖基化修饰,的实际分子量为33Kd左右,用经典的prion 蛋白抗体3F4(Sigma)进行WB可以证实。PrPc和PrPsc的大小都是33Kd,但可以通过蛋白酶K试验进行区分,PrPc进行蛋白酶解后不能被3F4抗体检测到,而PrPsc耐受蛋白酶K的作用。

prion 蛋白的结构已经研究得较清楚,列如下:
1-23aa:信号肽序列
23-90aa:脂筏靶向信号
51-90aa:8肽重复序列(与Cu离子结合部位)
180aa and 196aa:糖基化位点
112-145aa:疏水区
178aa和213aa形成二硫键
231-252aa:GPI锚定信号肽
2003-11-26 23:23
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楼主 icesugar75
icesugar75

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谢谢 milkmoon 和 cloner。

我对单独跑胶来判断分子量大小可以,但是,如何知道:

1。它是由原蛋白复制得来的?
2。它仍然保持其模板的感染活性?(cloner 已经解决了这个问题,下面的贴子画红加黑的部分:))

我们在前面的资料中可以看到,朊病毒蛋白的致病形式与非致病形式只是构象不同,是否有这种可能,复制后的蛋白就不具有感染能力了呢?

先把这个问题 hang on 在这里,哪位朋友有了想法或答案定来告知!

icesugar75 wrote:
prion 蛋白由254个氨基酸组成,其分子量应为26-27Kd,但由于prion的180位和196位有糖基化位点可被糖基化修饰,的实际分子量为33Kd左右,用经典的prion 蛋白抗体3F4(Sigma)进行WB可以证实。PrPc和PrPsc的大小都是33Kd,但可以通过蛋白酶K试验进行区分,PrPc进行蛋白酶解后不能被3F4抗体检测到,而PrPsc耐受蛋白酶K的作用。


cloner 的意思是:用一定的抗体可以识别有感染性的朊病毒,而没有感染性的不可被检测,是吗?不知这种说法是否有依据。从实验步骤看来这一步是技术关键。
2003-11-26 23:59
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icesugar75 编辑于 2003-11-28 00:51
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楼主 icesugar75
icesugar75

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我们来看一下 图1b:对朊病毒蛋白复制没有影响的一组酶

-- RNase V1:水解双链RNA
-- RNase H:水解 DNA-RNA 中的单链 RNA,对其它类型核酸没有作用
-- DNase: 没有 specify 到底是哪一种
-- EcoRI:降解 DNA 常用酶
-- Apyrase:腺酸水解酶,能将腺三磷酸(ATP)及腺双磷酸(ADP)水解成腺单磷酸(AMP)及无机磷
-- Heparinase III: 肝素酶

前四种酶的使用很好理解,排除了DNA-RNA,dsRNA, DNA 在复制系统中的作用。

用 apyrase 的目的是:排除高能量ATP, ADP 在系统中作用的可能。因为大家都知道,水解核酸时会产生这些小分子,是否这些小分子在系统中起作用,这个考虑很重要。

下面第 5 个过关问题:

使用 Heparinase III 的目的是什么?

BIINUS:3 分

问题提示:heparinase III 能水解什么样的蛋白,为什么要除去这种蛋白在系统中的作用?
2003-11-27 04:59
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bowlimg521
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现已有证据认为细胞内的RNA分子可以使prpc转化为prpsc
见nature oct.16 2003:717

谢谢参与,我们正在讨论这篇文章啊。:)
2003-11-27 16:03
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icesugar75 编辑于 2003-11-28 00:49
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