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Gene Expression Omnibus(GEO)数据库

管委会常务会议室版版主 · 发布于 2003-10-21 · IP 黑龙江黑龙江
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这个帖子发布于 22 年零 37 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/

GEO是一个高通量芯片表达谱数据库,允许high-throughput gene expression/genomic hybridization/antibody array experiments等方式获取的数据信息的提交/存取/检索,GEO作为信息数据集中和发布的hub,是传统实验室数据资源的有效补充。

GEO的三个入口:

GPL Platforms (平台):关于用于以高通量方式(microarray, SAGE)检查样本的物理试剂的信息。一个平台含有多个提交者提交的样本。

GSM Samples (样本):关于被检查的mRNA样本,实验条件,和实验产生的基因表达测量数据信息。一个样本必须涉及一个平台,可能会包括在许多系列之中。

GSE Series (系列):样本收集,样本是如何相关的,如何排序的,分析是如何进行的,和聚类数据是如何获得的信息。系列含有数据的摘要信息。









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