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求组：关于limma包算出来的logFC全部小于1

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楼主

入门站友

1楼

请问为什么用limma包算logFC，结果全部小于1，但是用GEO2R算出来有很多大于1的；

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2020-04-06 10:13 浏览 : 1887 回复 : 1

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丁香园准中级站友

+5 丁当
4楼

谢邀。

因为logFC不涉及统计检验，所以，请考虑两种方法的分组是否一致。为此，你需要仔细阅读关于分组的代码，做一下比较。

2020-04-06 10:46

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