细胞信号骨干站友
如题，是否可以用limma包对TCGA数据库FPKM格式数据进行差异表达分析？
众所周知，另外的两个著名的DEG分析R包，明确要求使用counts格式数据。
那么问题来了，FPKM格式数据有何用？能否用limma包对其进行差异表达分析呢？（我在某大神的视频里看到这样的操作，也听到来自其他大神反对的声音）
如果可以的话，能否给出文献支撑呢？如果不可以用，能否通俗易懂地给小白讲讲原因呢？
不知道邀请谁？试试他们
