最近想做lncRNA芯片数据挖掘,我看发表的文献基本上是先把芯片筛到的lncRNA和mRNA区分开,分别去做差异分析,然后在做共表达分析。我想请教的是,如何在一堆基因列表中分出lncRNA和mRNA?
不知道邀请谁?试试他们
stringson谢邀。这里用到了基因/转录本注释文件。注释的内容中,包括了lncR/mRNA的信息。Gencode、ensembl都有注释文件。具体用到的注释文件会写在文献方法学部分。
谢邀。
这里用到了基因/转录本注释文件。注释的内容中,包括了lncR/mRNA的信息。
Gencode、ensembl都有注释文件。
具体用到的注释文件会写在文献方法学部分。
谢谢您的回复。能请教一下具体操作步骤吗?