联合分析--竞争性内源RNA网络

竞争性内源RNA网络

竞争性内源RNA(ceRNA)[2]是近几年来的研究热点，是一种全新的转录调控模式。这些ceRNA能够通过miRNA应答元件（microRNA Response Element, MRE）竞争性的结合相同的miRNA来调节彼此的表达水平。ceRNA假说揭示了一种RNA间相互作用的新机制。ceRNA可以通过竞争性的结合miRNA来调控彼此的表达，如：microRNA可以导致基因沉默，而lncRNA竞争性的结合了microRNA，从而影响了microRNA导致基因沉默这一功能。这里，mRNA、lncRNA、circRNA等均可作为ceRNA。

ceRNA通常具有以下特点：

a）ceRNA均受miRNA调控；

b）ceRNA之间需具有相同的miRNA结合位点；

c）ceRNA之间存在相互调控关系，且表达水平变化趋势一致。

本项目通过miRNA的靶向关系来获取候选的ceRNA关系对，满足如下条件：

1) ceRNA之间相同的miRNA数目应大于5；

2) 超几何检验p值小于 0.01，校正后的fdr值小于 0.05；

3) 当样品数量大于等于5时，可以考虑ceRNA的表达水平，将共表达分析的结果考虑进来，即得到ceRNA之间两两均共表达的ceRNA共表达网络。否则不做考虑。

样品数量不少于5时，此处展示的是考虑共表达后的ceRNA结果。否则，展示的只是ceRNA的结果。