如何选择肠道菌群的研究手段（三）——宏转录组 【肠菌研究方法系列讲解】

宏转录组

         宏转录组（Metatranscriptome）：生态环境中全部微小生物的mRNA合集。很多流程与功能上，与宏基因组相似，只是在RNA分子水平上，并且过滤掉16Sr RNA等不翻译的RNA。

          上图是16S、宏基因组、宏转录组在功能上的差异，从上图知宏转录组的关注的重点是差异表达基因分析，这结果直接在功能上有体现（我准备干什么）。

          宏转录组的流程如下：RNA提取—rRNA去除—随机打断—测序—组装—注释分析—差异表达分析

           组装建库的过程与宏基因组相同：RNA提取，rRNA去除，超声打断，逆转录，合成双联cDNA，合并所有序列后去冗余的基因集，即宏转录组文库。

           文库构建完成，就能进行物种分析，与宏基因组相同，这里不再叙述，这里重点说一下差异表达量的分析方法。

            差异表达量分析与b-多样性分析有相似的地方，都是比较组件的差异，但前者范围比后者大，除了阴阳性有和无的质差外，还有量的差异：都有某些RNA，但含量上有差异。所以在结果呈现上，有下列不同图表。

                 关于这些图的解读，如果大家感兴趣可留言私聊，这里就不罗嗦了。下贴将聊聊宏蛋白组：

           http://www.dxy.cn/bbs/topic/42258289#42258289