想请教非癌症类型的疾病相分析差异基因的表达情况该用什么数据库进行分析？？
不知道邀请谁？试试他们
谢邀。
有啥数据库，就用啥数据库。
实在没有，就去GEO搜索一下。
GEO。
数据库不会用，请看：
http://www.dxy.cn/bbs/thread/38224586#38224586
仯杪mm 想请教非癌症类型的疾病相分析差异基因的表达情况该用什么数据库进行分析？？
对于这句话，我觉得你应该想表达的意思是：
1，数据在哪里进行检索？
你可能知道TCGA里面存储的数据都是与癌症相关的，所以才会有这样的疑问。其实还有其他的公共数据库比如最常见的GEO（什么疾病类型的数据都有，非疾病的数据也有，就连搞中药研究的数据也会有你的自己根据关键词去进行检索和筛选），SRA（高通量测序数据，什么类型的数据都有），GDSC（存储细胞系数据），exoRBase（专门存放外泌体数据的，样本好像是正常组织的样本来着）
还有针对SNP数据的专门数据库等等有好多数据库，你如果不知道可以谷歌。
2，差异分析方法是什么？差异分析方法与数据库没有关系，与样本组织是否为癌症样本也没有关系。与数据类型比如是芯片数据还是测序数据有关，比如常见的二代测序数据使用DEseq，DEseq2，limma，edgeR等算法。
