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miRNA靶基因预测网站或方法汇总

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楼主

stringson

丁香园准中级站友

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1楼

这个帖子发布于2年零137天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。

先来四个常用的预测网站。

miRTarBase - 2011-nar。实验验证的miR靶基因。输入文件：miRNA、gene。台湾交通大学维护。2018年更新。 PMID: 29126174

http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/php/index.php

miRDB - 2015-nar。miRNA靶基因预测。2014年停更。

http://mirdb.org/miRDB/

TargetScan - 2015-elife。多物种miRNA靶基因预测。人鼠虫蝇鱼。麻省理工大学David Bartel实验室维护。

http://www.targetscan.org

miRcode - 2012-bioinfo。miRNA的靶基因预测。包括与lncRNA互作。瑞典哥特堡大学Larsson实验室维护。2012年停更。

http://www.mircode.org

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2018-11-29 14:41 浏览 : 24130 回复 : 27

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aubrp

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2楼

谢谢分享

2018-11-30 10:15

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aubrp

入门站友

3楼

本人新手，想问一下楼主，查询收费吗？如果收费，是如何收费的？

2018-11-30 10:21

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楼主

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丁香园准中级站友

4楼

aubrp
本人新手，想问一下楼主，查询收费吗？如果收费，是如何收费的？

查询啥？哪个收费？

2018-11-30 14:42

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