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论坛首页  >  生物信息学讨论版   >  NGS & Microarray
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miRNA靶基因预测网站或方法汇总

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楼主 stringson
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这个帖子发布于2年零56天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

先来四个常用的预测网站。


miRTarBase - 2011-nar。实验验证的miR靶基因。输入文件:miRNA、gene。台湾交通大学维护。2018年更新。 PMID: 29126174

http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/php/index.php


miRDB - 2015-nar。miRNA靶基因预测。2014年停更。

http://mirdb.org/miRDB/


TargetScan - 2015-elife。多物种miRNA靶基因预测。人鼠虫蝇鱼。麻省理工大学David Bartel实验室维护。

http://www.targetscan.org


miRcode - 2012-bioinfo。miRNA的靶基因预测。包括与lncRNA互作。瑞典哥特堡大学Larsson实验室维护。2012年停更。

http://www.mircode.org

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2018-11-29 14:41 浏览 : 22613 回复 : 27
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谢谢分享

2018-11-30 10:15
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aubrp
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本人新手,想问一下楼主,查询收费吗?如果收费,是如何收费的?

2018-11-30 10:21
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楼主 stringson
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aubrp

本人新手,想问一下楼主,查询收费吗?如果收费,是如何收费的?

查询啥?哪个收费?

2018-11-30 14:42
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