没时间进行「湿实验」的临床医生或医学生； 对基础研究不熟悉的人员；想从芯片、测序海量数据中，获取有效的信息的科研人员；想通过生信分析提升研究基础的各类科研人员等等，都离不开「数据库」。

数据库有很多，接下来就给大家推荐几个常用的数据库，快收藏起来吧。

一、基因表达数据集

1. UCSC（http://genome.ucsc.edu/）

UCSC Genome Browser 基因组浏览器，根据基因组的位置、ID 等信息进行浏览，提供了 80 多个物种的基因组信息，可视化内容齐全，用户可根据需要加入注释信息。

2. Ensemble（https://asia.ensembl.org/index.html/）

Ensemble Genome Browser 在对真核生物的注释上功能非常强大，可以做到准确、全自动。

二、表达谱数据库

3. GEO（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds/）

Gene Expression Omnibus 世界上最大最全面的公共基因表达数据资源

4. Oncomine （https://www.oncomine.org/）

Oncomine 大型肿瘤基因芯片数据库，可用于分析基因表达差异。

5. ArrayExpress（https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/）

三、肿瘤数据库

6. Cosmic（https://cancer.sanger.ac.uk/cosmic）

Cosmic 最大的癌症基因突变数据库

7. TCGA（https://cancergenome.nih.gov/）

TCGA 与癌症基因组改变有关的数据库

8. cBioPortal（http://www.cbioportal.org/）

cBioPortal 整合了 126 个肿瘤基因组研究的数据，无需注册就能直接使用

四、miRNA分析预测

9. StarBase（http://starbase.sysu.edu.cn/）

StarBase 是研究 IncRNA/circRNA/microRNA 常用的数据库

10. miRBase（http://www.mirbase.org/）

著名的 miRBase 数据库之一，为研究者免费提供 miRNA 序列注释、预测基因靶标等信息

11. TargetScan（http://www.targetscan.org/）

五、疾病数据库

12. MalaCards（http://www.malacards.org/）

MalaCards 总结疾病相关信息，简便查询和了解疾病现状。

六、血管单细胞数据库

血管单细胞数据库（http://betsholtzlab.org/VascularSingleCells/database.html）是研究脑血管和肺血管的强大数据库。

（转载自：科研论文时间公众号）