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生物信息

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对GEO数据库GSE的选择

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楼主 Adrian-Gu
Adrian-Gu
神经外科
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这个帖子发布于2年零186天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
待解决问题 悬赏丁当:10 悬赏大厅

请问各位大佬,数据挖掘中对于自己希望选择的GSE有什么要求呢?

比如测序时间需要近期?

样本量的大小需要怎样估算或者是不能出现适合的结果从而改变样本的入组?

样本的case和control需要保持一定的比例?

测序作者的测序处理?

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2018-08-24 14:56 浏览 : 3455 回复 : 4
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dxy_1wo8jlv6
dxy_1wo8jlv6
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咋都没有人回复,我也有这个困惑

2020-08-19 19:55
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王天宇2012
王天宇2012
常驻站友

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满意答案
所选GSE: 1 每个GSE的样本数量尽量多,尽量新;2 物种要一致,尽量都是人的,没有的话退而求其次选动物的 ;type也要一致 ; 3 尽量保持平台platform一致,少选小公司的平台;4 sample必须要有对照组;
2021-01-16 09:18
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楼主 Adrian-Gu
Adrian-Gu
神经外科
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满意答案
王天宇2012
所选GSE: 1 每个GSE的样本数量尽量多,尽量新;2 物种要一致,尽量都是人的,没有的话退而求其次选动物的 ;type也要一致 ; 3 尽量保持平台platform一致,少选小公司的平台;4 sample必须要有对照组;
感谢回复。
2021-01-17 03:31 来自 Android客户端
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