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GWAS分析中的inflation factor (λ)

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楼主

kc2013

铁杆站友

1楼

这个帖子发布于2年零265天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。

问题已解决悬赏丁当:2

大家好，最近进行GWAS分析，之前看到文献中会计算inflation factor (λ)比如=1.05，解释成a low possibility of false-positive associations resulting from population stratification

inflation factor的取值范围是多少？是不是越低越好？我计算的inflation factor=1.00，该如何解释，谢谢！

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2018-05-08 10:03 浏览 : 1735 回复 : 2

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2楼

满意答案

简单地说 λ<1.01说明没有膨胀也就是群体结构对结果几乎没有影响

一般1.01<λ<1.05之间认为影响较小在可接受范围之内

而对于λ>1.1就需要进行矫正了

但是这只是通常的情况尤其是后面两条的cut值

不同人对这种基于genomic control的分析方法有不同的认识

我见过有的审稿人λ=1.01都要求矫正的

2018-05-08 13:45

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楼主

kc2013

铁杆站友

3楼

谢谢，如果λ=1.00，说明群体结构对结果几乎没有影响，不需要校正，对吧？

2018-05-08 14:19

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