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如何利用pymol对两个已知蛋白质进行空间结构比对并且如何计算RMSD值？

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楼主

常驻站友

1楼

这个帖子发布于2年零350天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。

问题已解决悬赏丁当:2

求助求助！！！

想用软件pymol对两个已知结构的蛋白质进行结构比对。下面的文件上有想做出来的效果，应该是彩色的但是由于是在文献上截图的。此图是两个蛋白质吻合的cartoon。而且还能通过pymol计算出RMSD值，希望能做出这个效果并且计算RMSD值，有哪位大神知道这个嘛？或者做过？有与此相关的教程吗？非常感谢非常感谢

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2018-02-03 11:21 浏览 : 13321 回复 : 14

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• 新冠疫苗保护效力79.34％意味着啥？

铁杆站友

2楼

满意答案

也可以用VMD

2018-02-03 15:30

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• 文献求助

楼主

常驻站友

3楼

我已经用pymol算出来了！！！

2018-02-03 21:18

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• 首张“新冠患者分子全景图”

入门站友

4楼

请问楼主怎么做到的！我也刚学，求赐教啊啊啊

2018-03-16 11:21

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• 乡镇卫生院入编制问题，请懂行的指点迷津，谢啦！