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[原创]初学者分享GEO在线分析工具的操作步骤

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楼主 康小杨
康小杨
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换个昵称叫大海

请问分组的时候只能分两组(实验组和对照组)才能比较吗,

我是这样做的。

2018-08-23 18:49
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楼主 康小杨
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换个昵称叫大海

前辈你好,我通过GEO2R分析的基因芯片为什么没有gene symbol?那下面的ID如何进行转换啊?

 

按理genesymbol应该是在最后一列。

2018-08-23 18:51
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康小杨

按理genesymbol应该是在最后一列。

前辈你好,今日私信用完了,只好在这上面请教你了,那我这个为什么没有gene symbol呢?这样的话,我下一步该怎么继续分析?

 

2018-08-23 18:58
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楼主 康小杨
康小杨
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换个昵称叫大海

前辈你好,今日私信用完了,只好在这上面请教你了,那我这个为什么没有gene symbol呢?这样的话,我下一步该怎么继续分析?

 

网上有很多genesymbol的转换软件,你搜一下吧。

我是用R语言做的,Y叔的包clusterprofiler了解下,

http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/clusterProfiler.html。

当然,也可以用jimmy团长的转换,,附送传送门:

http://www.bio-info-trainee.com/1399.html

如果不会R语言就用DAVID数据库的tools,里面也有genesymbol的转换:

https://david.ncifcrf.gov/

希望能帮助到你,祝好运~


2018-08-23 19:13
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