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生物信息

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TCGA数据库数据下载与整理,差异分析,lncRNA与mRNA分离,生存分析,ceRNA调控网络,miNRA差异分析,ID转换 [精华]

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楼主 bio_wolf
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pixie18

你好,请问主贴在哪里呢?谢谢

主贴就是这个帖子的第一页,不知道这样回答对不对

2017-10-26 10:27
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楼主 bio_wolf
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sharebool

请问您一下 TCGA数据库里不能下载正常对照组织的样本 全部都是癌症的样本数据 这个又是怎么回事呢


TCGA数据库常见的癌症有33种,其中有9种是没有癌旁样本的,遇到这种情况,可以考虑把癌症样本按照临床分成2类,再做差异分析,希望对你有帮助

2017-10-26 10:28
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leobobsix
leobobsix
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mark了,谢谢楼主
2017-10-26 10:46
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求助,这步怎么做?提取lncRNA矩阵选取antisense、lncRNA、sense_intronic等,这步是怎么提取的呢?我之前是手动在Excel表格中把LNC开头的找出,这样看来很不全面,想请前辈分享下具体的方法
2017-11-03 14:26 来自 iPhone/iPad客户端
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