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植物与农林科学

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利用CRISPR/Cas9技术在基因编码区敲除,少量碱基插入或缺失会影响基因的表达量吗???

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楼主 菽蔡先生
菽蔡先生
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这个帖子发布于4年零0天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

利用CRISPR/Cas9技术进行植物的基因敲除,敲除的位点在CDS(编码区),结果在靶点处引入了几个碱基的插入或缺失突变,现在的共识是这些少量碱基的插入或缺失(Indel)会导致移码突变,进而破坏掉相应蛋白功能,获得基因功能缺失的表型,也就是说CRISPR/Cas9行使作用是在蛋白水平了。

请问,CRISPR/Cas9引入的少量碱基的突变会影响基因的表达量吗(非可变剪切位点)?我个人觉得RNA水平上几个碱基的改变对基因的表达量影响不大。有人做过相关实验能够证明CRISPR/Cas9基因敲除只是移码突变而不影响基因的表达量吗?

若是CRISPR/Cas9的敲除既产生了移码突变又能够改变RNA水平基因的表达量,又怎样确定某个基因的功能到底是通过RNA还是蛋白行使功能呢?

希望大神能够不吝赐教,万分感谢。


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2017-03-08 17:06 浏览 : 5320 回复 : 5
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yaoyao09
yaoyao09
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最近在细胞水平做crispr/cas9,异常痛苦,我做过qPCR实验,碱基缺失对RNA的水平影响不大,大概10%左右,主要是碱基缺失产生的移码突变,导致蛋白翻译的错配或者提前终止。

2017-03-10 09:38
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楼主 菽蔡先生
菽蔡先生
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朋友,你做的结果中移码突变导致翻译提前终止的材料表达量也没有变化吗?你说的10%是下降吗?


2017-03-10 16:14
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rfge
rfge
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  • 4楼
若有合适的剪切位点,不排除产生剪接体,但整体转录本的量可能部受影响

2017-03-19 11:05 来自 iPhone/iPad客户端
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