哪些眼部微生物与圆锥形角膜有关？

      圆锥形角膜是一种以非炎性突出为特征的眼科病，现有研究主要探讨了基因、代谢、免疫、内分泌及形态学与该病的关联。本研究通过测序技术，分析了眼部微生物与圆锥形角膜形成的关联。

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题目：Metagenomic Analysis of Human Lens Microbiota Associated with Ophthalmic Diseases

译名：利用宏基因组学分析眼部微生物与眼科疾病的关系

期刊：BioNanoScience

发表时间：2016

通讯作者：E I Shagimardanova

单位：俄罗斯喀山联邦大学

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材料与方法

样品来源：12个眼病患者的隐形眼镜微生物样品，包括6例圆锥形角膜患者（kk）、3例角膜结膜炎（kc）、3例近视（my）。

测序策略：16S rDNA测序，V1-V5区。

测序平台：454测序平台。

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研究成果

① 通过12位患者眼部微生物测序发现，患者眼部细菌主要为变形菌门（Proteobacteria占90%以上）、α-放线菌门及厚壁菌门（表1）。酸杆菌门（Acidobacteria）并不是在所有样品中都有，但在一个结膜炎样品（kc2）中含量非常高；厚壁菌门Firmicutes在样品中占比例很少，但在其中一个圆锥角膜炎样品（kk4）中比例很高，可能与疾病相关。

表1. 12例患者眼部核心微生物（门水平）的相对丰度

② 所有样品中检测到的150多种菌株，主要属于肠杆菌目（平均占52.7%）、假单胞菌目（25%）、伯克氏菌目（5.4%）、鞘脂单胞菌目（5.1%）、根瘤菌目（4.4%）、乳杆菌目（1.3%）、放线菌目（1.2%）、柄杆菌目（1.2%）、芽孢杆菌目（1%）。

图1. 12例患者眼部微生物在属水平的分布比例

       已有的测序研究发现，健康人结膜中含有的微生物主要为干燥棒杆菌属、棒状杆菌属、葡萄球菌属、链球菌属、支原菌属、奈瑟氏菌属和革兰氏阴性细菌莫拉克斯氏菌属。本研究中检测到隐形眼镜上微生物主要为肠杆菌科和伯克氏菌科（包括鞘氨醇单胞菌、假单胞菌、茎菌属、罗尔斯通菌属、甲基杆菌属、布鲁氏菌、根瘤菌和耶尔森菌属），检测到的病原微生物主要包括革兰氏阳性球菌（金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌）和革兰氏阴性细菌家族——肠杆菌科 （包括埃希氏菌属，克雷伯氏菌属）和绿脓杆菌科，同时检测到了乳酸杆菌家族细菌（包括葡萄球菌属, 链球菌属和肉食杆菌属）。

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研究结论

       不同时段收集的样品，微生物物种组成是稳定的，眼科疾病患者眼部细菌主要为变形菌门，还找到了与疾病相关的一些微生物。

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亮点

        眼部取样测序比较困难，作者用独特的视角研究了眼部微生物与眼科疾病的关系，为临床治疗提供了理论基础。

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来源：ruilijiyin

编辑：天益君

• Metagenomic Analysis of Human Lens Microbiota Associated with Ophthalmic Diseases.pdf(301.78k)