今天是在二医大上课的第三天，没想到就听到了一场大牛的讲座，讲座的主角是George Weinstock教授，来自美国的Jackson Lb. for genomic medicine。

    这个讲座是免疫学研究所主办的，目标人群应该是免疫学研究的学生，甚至说是博士生，对于我这种初入二医大的菜鸟，也只有膜拜的份了。

    对于整个讲座的主要内容——Microbiome，我还是有所了解的，毕竟目前肠道微生物致病的学说一直沸沸扬扬。对于G.W教授今天的讲座，我不敢说听明白了，但是也还是想整理整理自己的笔记，留个纪念。

第一部分：介绍microbiome理念的形成

G.W.教授首先介绍了microbiome和metagenome（宏基因组学，广义宏基因组是指特定环境下所有生物遗传物质的总和，它决定了生物群体的生命现象。狭义宏基因组学则以生态环境中全部细菌和真菌基因组DNA作为研究对象）。

随后提出了一个令人吃惊的理论（原谅我没见过世面）——人体中有10%的部分是属于人体细胞组织，90%的成分是细菌——一个人类个体中，有23000+的人类基因，却有1000000+的细菌基因。

之后又提出“Bacterial 16S rRNA gene is different between each bacterium(>97%)"。其中提到的16S rRNA是细菌的系统分类研究中最有用的和最常用的分子钟，其种类少，含量大（约占细菌RNA含量的80%），分子大小适中1.5kb左右，存在于所有的生物中，其进化具有良好的时钟性质，在结构与功能上具有高度的保守性。在16S rDNA有V1-V9共九个不同的基因位点被认为是variable regines，这些位点的RNA形态都是茎环形的，故不稳定。

第二部分：方法学介绍

    此图来自于 George Weinstock教授的演讲PPT：

    此图来自于 George Weinstock教授的演讲PPT：

    主要是一个收集标本，提取DNA和RNA，高通量复制和对比的过程。

第三部分：研究举例

    1.哮喘与家庭中真菌（具体来说是18S rRNA)的发病关联(做了灰尘和空气两个大方面）；

    2.病毒与人类之间的联系；

    最后提出由自体microbiome所带来的生态学疾病（Ecological disease）的特点，详见下图：

    此图来自于 George Weinstock教授的演讲PPT

第四部分：能否用细菌治疗来疾病的研究

举例说明，1.提出问题：how to treat an antibiotic resistant?  2.提出方法：microbiome therapy ——Fecal transplants  3.结果：能够很好地治疗C. difficile(艰难梭状芽孢杆菌）感染。

提出问题2：how to identify the protective species?  他们的研究找出了4 kinds of  protective species；

提出问题3：Is there “Golden Microbiome”?  他们对运动员和健康正常人进行了检验和对比，得出具有差异性的结果。

第五部分：新理念的形成

    此图来自于 George Weinstock教授的演讲PPT：

补充部分：

技术部分：

    1.Next generation sequencing的产生和发展有望可以检测“百万”级的碱基序列；

    2. George Weinstock教授在基因层面的研究主要依赖mWGS & RNA测序这些技术手段获取相应的数据，并进行数据的分析；

    3.新生儿的microbiome可作为最原始的microbiome——这一点在逻辑上是能理解的。

其他：

    1. George Weinstock教授提取信息的能力令人钦佩。在自由发问缓解，学生们往往习惯于先引用教授在讲座中提到的内容，再尽可能详细地表述自己的问题，但是这样的表达虽然详细，但缺乏直观感受，让人一下子抓不住你想要问什么。而 George Weinstock教授在学生提问完后，往往会用一句话so you want to say……很直白很精确地来总结我们的提问。这是一种能力！其实我之前也与一些国外的教授有过交流，对于我所提出的问题中繁琐的内容，他们都会习惯于简化为一句话“所以你想问的是…”那么，化繁为简、从中提取关键信息，已经不能说只是一种能力，也应该是一种习惯了。不管是能力，还是习惯，都是我需要培养的。

    2.今天的讲座全英文，对于练练听力也算是不错的，可以看到自己的不足。

    3.从最后的自由提问环节中，无论是老师还是学生的提问，水平都很高，也挺热烈的，这里的学术氛围要比本科学习好很多。