无参考基因组如何对新的物种做研究？

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我要研究的一种鱼类没有参考基因组，只通过RNA-seq获得了mRNA的序列。

如果我想研究某些基因在特殊处理后的可变剪接，insert，deletion，等一些变化，如果拿已有的转录组序列作为参考序列是否可以实现上述目的？

在或者我将感兴趣的基因全长（包括启动子，外显子，内含子）扩增出来作为参考序列是否可行？但是我查了一下有一个基因在斑马鱼中的长度有100k，请教各位应如何得到此基因的全长序列？

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2016-04-08 09:00 来自 iPhone/iPad客户端浏览 : 23374 回复 : 0

PCR技术