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遗传发育

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关于多发家系测序研究如何确定遗传模式,表型与基因型共分离判断,疾病与基因相关性等?

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楼主 2010baal
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各位大侠好,最近收集了一个疾病的多发家系,对核心家系的4个人进行了外显子测序,找到一个X基因的一个位点在其中一个转录本上存在无义突变G→A,且患者均为AA纯合子。然后我将家系进行扩展并进行X基因的sanger测序,发现扩展后的家系其他患者也是AA纯合子。我现在遇到几个问题:1、如何根据家系图确定该家系的遗传模型,显性?隐性?部分显性?
2、如何判断表型(疾病)与基因型是否共分离?
3、如何对该基因的突变进行功能预测?
4、如何根据sanger测序结果并结合家系图谱计算X基因与疾病的相关性?
请懂的大侠帮帮忙?谢谢了!
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2016-01-18 20:53 浏览 : 8967 回复 : 10
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楼主 2010baal
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2016-01-18 23:16
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gyhit



1. 最好把家系图以及家系内各成员的基因型放出来啊,才好看明白;

2. 出现这么多AA的情况,要返回去看下,你找到的这个无义突变所依据的转录本是否是主要转录本,是不是文章中研究的常见的转录本;看一下这个变异在普通人群中的分布频率,按照你的说法,如果不是频繁的近亲结婚,这个位点很可能在普通人群中分布频率蛮高的,如果是这样的话,很可能与疾病没有关系;

先确定以上的内容,在考虑以后的功能分析吧。



该变异G→A是罕见变异!
2016-01-26 10:00
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