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【求助】检测拷贝数变异时选择区域的大小
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amtf_2018
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丁当
1楼
这个帖子发布于
6年零97天
前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
问题已解决
悬赏丁当:2
大家好,最近准备开展拷贝数变异检测 我们知道拷贝数变异不像SNP 往往具有几十K bp的大小,那么我在检测一个染色体区域(该区域为GWAS报道的可能影响疾病发生的易感区域)的拷贝数变异时,该区域应该选择多大范围?
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2014-12-02 10:28
浏览 : 1568
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grey880329
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丁当
2楼
你好,你是做基因检测的吗?麻烦你帮我看看我的这种情况该怎么办好吗?无限感激
http://www.dxy.cn/bbs/topic/29458893
2014-12-02 20:49
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zhulikou431
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3楼
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http://search.dxy.cn/?bid=157&words=%E6%8B%B7%E8%B4%9D%E6%95%B0%E5%8F%98%E5%BC%82%2B%E9%80%89%E6%8B%A9%E5%8C%BA%E5%9F%9F#result
2014-12-12 10:26
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丁当
4楼
首先你要明确关注的区域里面有哪些基因,因为最后的功能意义还是要落到基因单位。
知道该区域里面的基因以后,根据经费和不同的技术方法选检测片段数目,一般是每个基因上1-2个探针(2个最好,能起到相互验证作用,也防止低频突变或者SNP造成假阳性),首尾外显子各一个探针呗。如果该区域内基因特别多,重点关注其中有可能有意义的基因。
另外,一批样本检测完以后,可以视结果读探针位置进行修改。
2014-12-17 15:29
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