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求助:GEO数据分析

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楼主 我恨果冻
我恨果冻
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  • 1楼
这个帖子发布于6年零283天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
在下新手,想用GEO中的array数据做差异表达基因筛选。请问应该下载的文件是什么?后续如何打开?或者有没有经典的,关于GEO数据分析的文献?文献可以告诉我名字,我去搜索。谢谢啦!
补充:GESXXX_RAW.tar是用于分析的数据吗?里面的.cel文件如何打开?我还下载了一个文件 GESXXX_series_matrix.txt.gz,请问这个文件是做什么的?里面的数值基本都是小于0的。
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2014-05-22 00:05 浏览 : 15628 回复 : 23
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我恨果冻 编辑于 2014-05-22 00:31
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ray1919
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可以用NCBI的自带在线工具,GEO2R,如果需要更细致的分析,可以修改其代码
2014-05-22 10:00
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jjjscuedu
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cel file 可以用 Expression console 分析
2014-05-22 13:11
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snowhiteleng
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  • 4楼
.cel文件是原始的芯片文件,可以用于分析
2014-05-23 15:01
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