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求助：GEO数据分析

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楼主

入门站友

1楼

这个帖子发布于6年零79天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。

在下新手，想用GEO中的array数据做差异表达基因筛选。请问应该下载的文件是什么？后续如何打开？或者有没有经典的，关于GEO数据分析的文献？文献可以告诉我名字，我去搜索。谢谢啦！
补充：GESXXX_RAW.tar是用于分析的数据吗？里面的.cel文件如何打开？我还下载了一个文件 GESXXX_series_matrix.txt.gz，请问这个文件是做什么的？里面的数值基本都是小于0的。

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2014-05-22 00:05 浏览 : 14984 回复 : 23

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我恨果冻编辑于 2014-05-22 00:31

• 硕博学历的医生都要去大城市，县人民医院连硕士都招不到了

常驻站友

+5 丁当
2楼

可以用NCBI的自带在线工具，GEO2R，如果需要更细致的分析，可以修改其代码

2014-05-22 10:00

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• 双氧水的“毒”，深入人“心”

常驻站友

+5 丁当
3楼

cel file 可以用 Expression console 分析

2014-05-22 13:11

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• 透析导管相关静脉血栓的超声表现

入门站友

+5 丁当
4楼

.cel文件是原始的芯片文件，可以用于分析

2014-05-23 15:01

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• 双氧水的“毒”，深入人“心”