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miRNA高通量测序 [精华]

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楼主 ssxie
ssxie
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yangyunhonga

楼主我能再请教下吗?我按照readcount排序,但是readcount数值比较大的miRNA对应的foudchange值却不高,都小于1,我开始定的阈值是2,现在一降再降到1.0,不知道具体要看readcount值还是FC值,还有Foldc值设置为1可行吗?readcount低值设置在多少合适,我看有的文献定为100?感谢!

readcount代表表达丰度,低丰度的,但差异表达,其实也是可以作为候选靶点研究,但是检测都比较麻烦,推测你情况是高表达的miRNA差异不大或不显著,这个看你的目标了,推测你可以选择差异2倍以上,readcount比如50或100等,具体还是在于你的选择

2018-11-01 20:27
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小学生专被坑
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请问楼主,现在研究miRNA是不是过时了?


2018-11-03 23:51 来自 Android客户端
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楼主 ssxie
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小学生专被坑

请问楼主,现在研究miRNA是不是过时了?


只是说不断有新的热点,miRNA研究不是那么热,对于 是否 过时,这个还真未必,miRNA是一类主要调控性的分子,很多功能未知,还是有很多实验室在研究,看你自己怎么认为了

2018-11-04 20:01
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爍爍桑89
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科研小白一枚,想问下,通过数据库可以自己做测序吗


2018-11-18 00:39 来自 iPhone/iPad客户端
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