【资源共享】介绍一款靶基因预测软件，可方便取交集

mirTargets 1.2 靶基因预测软件使用说明 1、声明：
虽然作者对靶基因预测结果进行了验证，但是不对结果的准确性承担责任。
2、软件采用的数据库版本：
1）、TargetScan：Release 7.0
2）、MicroCosm：Version 5.0
3）、Pictar：http://pictar.mdc-berlin.de/cgi-bin/new_PicTar_vertebrate.cgi（Lall et al 2006）
4)、miRDB：Version 5.0
3、软件功能
本软件可以方便的完成TargetScan、MicroCosm、Pictar和miRDB靶基因的预测、结果输出和取交集（图1）。

图11、预测miRNAs的靶基因
在①中输入miRNAs的列表，勾选使用的数据库，⑤中箭头选择为“→”，点击“预测”按钮。②中显示已完成预测的miRNAs列表，如果完成预测后，在②中没有您输入的miRNAs表示您勾选的数据库中没有该miRNAs的靶基因数据。点击“导出结果”按钮可以导出您输入miRNAs所有的靶基因预测结果。
您可以通过勾选②中一个或多个miRNAs、选择由几个数据库取交集、点击“变换交集”按钮来取得这些miRNAs靶基因的集合，取交集的结果显示在③中。
2、预测靶基因的miRNAs
在③中输入靶基因gene symbols的列表，勾选数据库，⑤中箭头选择为“←”，点击“预测”按钮。②中显示已完成预测的gene symbols列表，如果完成预测后，在②中没有您输入的gene symbol表示您勾选的数据库中没有该gene symbol数据。点击“导出结果”按钮也可以导出预测到的miRNAs。
您可以通过勾选②中一个或多个gene symbol、选择由几个数据库取交集、点击“变换交集”按钮来取得这些预测的miRNAs集合，取交集的结果显示在①中。
3、gene symbol和Req ID的转换
③中的gene symbol和④中的Req ID可以通过点击“>”和“<”箭头按钮完成相互转换。
2015年9月28日
本软件为绿色版，无需安装，解压后双击“mirTargets.exe”即可运行程序。