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遗传发育

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论坛首页  >  遗传学与发育生物学讨论版   >  医学遗传学
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【交流】hapmap等位基因频率、基因型频率查询

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楼主 joe_zhang
joe_zhang
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这个帖子发布于7年零19天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。
问题已解决悬赏丁当:5
各位站友，想有问题请教。
我近日投稿基因多态性meta分析一篇，某一基因型SNP频率与中国人群的关系。
审稿人提出一下问题：
（1）were these frequencies consistent with those reported in databases e.g. HapMap?
请问
一、 我怎么查询这一基因在中国人群的分布，即是说怎么查询hapmap？
二、 审稿人是要了解这个基因的GWAs中国人群结果吗？
还请赐教，非常感谢!
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2014-02-15 11:43 浏览 : 2507 回复 : 4
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满意答案
就是问你 你文中得出的频率是否与HapMap这类数据库中的记录相吻合
不知道你有没有在这些数据库（各种各样的SNP数据库）中进行过比对
如果有 列出来 如果没有 马上去做这件事
2014-02-15 17:29
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rongtongtong
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满意答案
joe_zhang
各位站友，想有问题请教。
我近日投稿基因多态性meta分析一篇，某一基因型SNP频率与中国人群的关系。
审稿人提出一下问题：
（1）were these frequencies consistent with those reported in databases e.g. HapMap?
请问
一、 我怎么查询这一基因在中国人群的分布，即是说怎么查询hapmap？
二、 审稿人是要了解这个基因的GWAs中国人群结果吗？
还请赐教，非常感谢!

可以用UCSC数据库，搜索该位点，然后查询该位点的CHB频率
2014-02-15 19:28
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楼主 joe_zhang
joe_zhang
心血管内科
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  • 4楼
Davidzjy
就是问你 你文中得出的频率是否与HapMap这类数据库中的记录相吻合
不知道你有没有在这些数据库（各种各样的SNP数据库）中进行过比对
如果有 列出来 如果没有 马上去做这件事

应该如何查啊？
2014-02-16 19:36
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