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【求助】notch1基因多态性求助

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楼主

wowowo28

心血管内科

入门站友

1楼

这个帖子发布于6年零349天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。

问题已关闭悬赏丁当:2

各位高手，有谁能不能帮忙查一下notch1的snp，为什么我查不到呢，可以告诉我输入什么也行，谢谢大家啊

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2014-02-11 19:46 浏览 : 932 回复 : 3

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2楼

dbSNP (480个)：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/snp_ref.cgi?geneId=4851
Genecard (2267个):
http://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=NOTCH1&snp=2267#snp

2014-02-12 09:58

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楼主

wowowo28

心血管内科

入门站友

3楼

Davidzjy
dbSNP (480个)：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/snp_ref.cgi?geneId=4851
Genecard (2267个):
http://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=NOTCH1&snp=2267#snp

你好，你可以用hapmap搜到吗，上面两个我没用过，他们可以限定人群，限定到中国，maf大于0.05吗

2014-02-12 15:05

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三师兄

入门站友

4楼

要查SNP，首先你要确定你选的标准：
1，如果是选择tagSNP，那么就需要确定人群，MAF以及r2值；
http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/cgi-perl/gbrowse/hapmap27_B36/
2，如果是功能候选SNP，一般就是指处在外显子改变氨基酸的或者3'UTR,5'UTR的，还需要规定MAF以及人群；
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
3，如果是别人文章中的，那么就可以直接输入rs号就行了。

2014-02-13 21:16

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