发帖
每发1个新帖
可以获得0.5个丁当奖励
回帖

【求助】连锁不平衡结果分析

查看全部
页码直达：
直达末页

楼主

sunmay98

实验中心

入门站友

1楼

这个帖子发布于7年零41天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。

待解决问题 悬赏丁当:2 悬赏大厅

最近在分析几个基因位点间的连锁不平衡，得出了单倍体分析结果如下：求助哪位大仙帮我分析看看，我不明白的是从总的结果分析中显示，是哪个单倍体型在实验组中和对照组中有差异。单倍型G A C C G和G T A C G在实验组和对照组中吗，比例是3和0的差异。
(All those frequency<0.01 will be ignored in analysis.)Loci chosen for hap-analysis: rs1, rs2, rs3, rs4, rs5Case(freq) Control(freq) Chi2 Fisher's p Pearson's p Odds Ratio [95%CI]G T A C A 0.00(0.000) 1.01(0.003) - - - -G T A T A 0.00(0.000) 2.00(0.007) - - - -G T A T G*0.92(0.005) 7.99(0.028) 2.418 0.120014 0.119943 0.183 [0.031~1.096]G T C C G*3.08(0.018) 3.02(0.010) 0.412 0.520855 0.520844 1.679 [0.339~8.307]G T C T A 1.00(0.006) 1.01(0.003) - - - -G T C T G*0.92(0.005) 6.98(0.024) 1.880 0.170422 0.170344 0.211 [0.035~1.281]T A A C A*158.84(0.902)263.96(0.910) 0.424 0.515221 0.515209 0.794 [0.396~1.592]T A A C G 0.00(0.000) 2.02(0.007) - - - -T A A T A*4.16(0.024) 2.02(0.007) 2.283 0.130840 0.130767 3.414 [0.630~18.505]G A A C G 1.00(0.006) 0.00(0.000) - - - -G A C C G*3.00(0.017) 0.00(0.000) 4.928 0.026468 0.026445 -G T A C G*3.08(0.018) 0.00(0.000) 5.062 0.024495 0.024473 --------------Global result:Total control=290.0, total case=176.0Global chi2 is 17.841415 while df=6 (frequency<0.01 in both control & case has been dropped.)Fisher's p value is 0.006707 Pearson's p value is 0.006641-------------------------------------

邀请讨论

搜索

2013-12-18 16:53 浏览 : 448 回复 : 0

投票
收藏
打赏
引用
分享
- 微信扫一扫
- 新浪微博
- 丁香客
- 复制网址
举报
- 广告宣传推广
- 政治敏感、违法虚假信息
- 恶意灌水、重复发帖
- 违规侵权、站友争执
- 附件异常、链接失效
- 其他

sunmay98 编辑于 2013-12-18 20:10

• 辞职心路（附选择科室的注意事项）

遗传发育

【求助】连锁不平衡结果分析

提示

丁香园旗下网站

关于丁香园

官方链接

遗传发育

分享到：

微信扫一扫

【求助】连锁不平衡结果分析

微信扫一扫

提示

丁香园旗下网站

关于丁香园

官方链接