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【求助】单倍型分析求助

楼主

常驻站友

1楼

这个帖子发布于7年零70天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。

问题已关闭悬赏丁当:5

目前在做一项SNP与疾病关联性的研究，数据分析阶段遇到如下难题：
下面附图为A基因的9个SNPs的连锁不平衡分析图，图上显示的数值为R²，想请教如何进行后续的单倍型分析。
我的疑问是应该按照Block为单位来分析每个Block构成的单倍型与疾病的关联呢？还是应该根据LD的结果，选出不连锁的SNP构建单倍型，再分析与疾病的关联？

忘各位大侠赐教，如果大家有什么好的心得也希望能够交流，谢谢

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2013-12-18 16:46 浏览 : 6933 回复 : 6

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入门站友

2楼

建议用这个在线分析软件进行单倍型分析
http://analysis.bio-x.cn/myAnalysis.php

2013-12-18 16:57

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楼主

常驻站友

3楼

sunmay98
建议用这个在线分析软件进行单倍型分析
http://analysis.bio-x.cn/myAnalysis.php

谢谢你的回答，我打算用R软件进行统计分析，所以并不是软件的问题。而是想知道选择哪些SNP进行单倍型分析。

2013-12-18 17:07

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• 过个年，因为收入受到了暴击

入门站友

4楼

我想请教下为什么要用单倍型分析？我研一，在读文献时对这个问题很困惑，希望大哥给小弟指点指点。

2013-12-20 10:41

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