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遗传发育

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【求助】基因型频率有意义,等位基因频率没有意义,正常吗?

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楼主 solovely
solovely
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这个帖子发布于7年零185天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
问题已解决悬赏丁当:5
如题,本人最近做的是一个单核苷酸多态性相关的课题,病例组例数507,对照组例数493 。统计分析结果显示,病例组和对照在基因型频率上存在显著性统计学差异,但奇怪的是等位基因频率分析却没有统计学意义。想请问各位大神,这样的结果正常现象吗?
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2013-09-02 17:54 浏览 : 2742 回复 : 4
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楼主 solovely
solovely
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  • 3楼
anyida05
有可能出现的。
不过 HWE是否平衡,某一基因型的频率是否比较低?

还有一个问题就是,我选的基因除了存在单核甘酸多态性之外,还存在一个长度多态性,所以所谓的HWE平衡是否只针对单核甘酸多态性呢,还是长度多态性同样需要检验HWE平衡呢?
2013-09-03 21:30
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楼主 solovely
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  • 6楼
buyao0
这没有什么不正常的,做统计要时刻记得的是,任何结果都有可能出现,区别只是概率大小的问题,特别是如果你的所谓阳性结果其实也只是在显著性边缘而已
长度多态的分析一样是符合HWE的,但是因为长度多态往往涉及到多个allele,计算方法比biallelic 的情况要更为复杂一些,如果多态会随着不同generation改变,如脆性x综合症那样,计算就更加复杂
非常感谢你的答复,我还想再请教下长度多态的分析HWE是如何计算的呢,我也是按SNP 的HWE计算方法算的
2013-09-11 11:01
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