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【求助】GWAS阳性位点验证

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楼主

铁杆站友

1楼

这个帖子发布于7年零158天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。

问题已解决悬赏丁当:2

大家好：自己目前的课题是基于欧美人群GWAS阳性位点在中国人群的验证。之前看过不少文章直接把欧美人群GWAS阳性位点在中国人群进行大样本验证，也可以发表在比较好的SCI杂志上。我的思路大致也是如此，在研究设计时除了选择GWAS阳性位点，还在GWAS阳性位点所在基因启动子区域（上游1kb之内）选择了2个功能性SNP位点，因为GWAS阳性位点在基因上游大约10kb，不大可能对基因表达产生调控作用。现在已经完成基因分型和初步统计，结果发现，GWAS阳性位点在自己样本中仍然有统计学意义，但启动子区域（上游1kb之内）的2个功能性SNP位点却无统计学意义。现在开始写文章，就遇到问题了，是只写GWAS阳性位点还是把2个功能性SNP位点也加上？自己的结果只是验证了之前的GWAS阳性位点，由于2个功能性SNP位点没有统计学意义，一起加上是不是就显得多余？反而让审稿人提出问题？

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2013-08-22 10:34 浏览 : 2000 回复 : 8

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常驻站友

2楼

满意答案

做了这么多工作，为什么不报？群体遗传学方面不能完全重复在其他人群的结果，可以说是极其常见的事情，阴性的结果也是很宝贵的信息。我推荐你多看看其他populational genetics 方面的文章，看看其他人是如何讨论与前人不相符合的结果的，看几篇就知道大概怎么写了

2013-08-22 13:47

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楼主

铁杆站友

3楼

谢谢回复。之前我也考虑过这个问题，准备一起写上去。但考虑自己选择的2个功能性位点无统计学意义，文章最后的结论还是GWAS阳性位点在中国人群中有意义。所以觉得与其这样还不如把GWAS阳性位点和2个功能性位点分开写文章。

2013-08-22 14:27

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楼主

铁杆站友

4楼

欢迎继续讨论！

2013-08-26 08:19

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