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【专题讨论】各位战友，在做全基因组关联分析时如果SNP哈迪温伯格平衡<0.0001为什么要排除，说明什么呢？

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楼主

入门站友

1楼

这个帖子发布于7年零231天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。

问题已关闭悬赏丁当:2

各位战友，在做全基因组关联分析之前为什么需要对SNP进行哈迪温伯格平衡检验？该检验不是用来检验个体是否能够代表群体的吗？怎么用来检验SNP了呢？如果SNP哈迪温伯格平衡<0.0001为什么要排除，说明什么呢？

谢谢各位啦！

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2013-07-18 10:11 浏览 : 1560 回复 : 2

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楼主

入门站友

3楼

谢谢。
也就是说偏离HWE的SNP可能是基因分型错误？那前提是不是就默认了所分析群体符合HWE？为什么有的文章中对SNP质控时没有进行HWE呢？

2013-07-18 16:19

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