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遗传发育

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【求助】关于fine mapping和imputation SNPs

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楼主 amtf_2018
amtf_2018
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这个帖子发布于7年零215天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
问题已解决悬赏丁当:2
各位老师,最近在看文献时发现几个名词,具体含义不是很清楚。一个是fine mapping,字面上意思是精细作图,具体意思还是不大清楚。第二个就是imputation SNPs,理解为是归因SNP,对吗?下面是文章的句子
To identify possible causal variants in the region, we genotyped 16 tagging SNPs and imputed 29 additional SNPs in approximately 65 kb genomic region at 10q11 in a Swedish population-based case-control study.这句话该如何理解?
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2013-06-28 10:54 浏览 : 2627 回复 : 5
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larryyale
larryyale
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满意答案
gwzh008
各位老师,最近在看文献时发现几个名词,具体含义不是很清楚。一个是fine mapping,字面上意思是精细作图,具体意思还是不大清楚。第二个就是imputation SNPs,理解为是归因SNP,对吗?下面是文章的句子
To identify possible causal variants in the region, we genotyped 16 tagging SNPs and imputed 29 additional SNPs in approximately 65 kb genomic region at 10q11 in a Swedish population-based case-control study.这句话该如何理解?
Imputation SNPs, these SNPs are not obtained from your experiments, instead based on ,e.g., genome 1000 project as reference, linkage to imputed.
2013-06-29 02:48
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buyao0
buyao0
遗传
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fine mapping就是用遗传方法进一步缩小候选定位的区间
2013-07-02 02:30
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楼主 amtf_2018
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谢谢回复,欢迎大家继续交流!
2013-07-02 09:11
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