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【求助】关于fine mapping和imputation SNPs

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楼主

amtf_2018

铁杆站友

1楼

这个帖子发布于7年零294天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。

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各位老师，最近在看文献时发现几个名词，具体含义不是很清楚。一个是fine mapping，字面上意思是精细作图，具体意思还是不大清楚。第二个就是imputation SNPs，理解为是归因SNP，对吗？下面是文章的句子
To identify possible causal variants in the region, we genotyped 16 tagging SNPs and imputed 29 additional SNPs in approximately 65 kb genomic region at 10q11 in a Swedish population-based case-control study.这句话该如何理解？

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2013-06-28 10:54 浏览 : 2696 回复 : 5

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larryyale

入门站友

2楼

满意答案

gwzh008
各位老师，最近在看文献时发现几个名词，具体含义不是很清楚。一个是fine mapping，字面上意思是精细作图，具体意思还是不大清楚。第二个就是imputation SNPs，理解为是归因SNP，对吗？下面是文章的句子
To identify possible causal variants in the region, we genotyped 16 tagging SNPs and imputed 29 additional SNPs in approximately 65 kb genomic region at 10q11 in a Swedish population-based case-control study.这句话该如何理解？

Imputation SNPs, these SNPs are not obtained from your experiments, instead based on ,e.g., genome 1000 project as reference, linkage to imputed.

2013-06-29 02:48