• 论坛首页
  • 我的丁香客
  • 找人
    查找好友
  • 更多
    丁香园
    丁香通
    丁香人才
    丁香会议
    丁香搜索
    丁香医生
    丁香无线
    丁香导航
    丁当铺
    文献求助
    医药数据库
    丁香诊所
    来问医生
登录 注册

遗传发育

关注今日：8 | 主题：69426
论坛首页  >  遗传学与发育生物学讨论版   >  医学遗传学
  • 发帖
    每发1个新帖
    可以获得0.5个丁当奖励
  • 回帖

分享到：

  • 微信

    微信扫一扫

  • 微博
  • 丁香客
  • 复制网址

【求助】haplo.stats 计算进行单倍体分析，能计算OR吗

  • 只看楼主
  • 页码直达：
  • 直达末页
楼主 longjx12345
longjx12345
入门站友

  • 0
    积分
  • 10
    得票
  • 40
    丁当
  • 1楼
这个帖子发布于8年零18天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。
问题已解决悬赏丁当:2
haplo.stats 计算进行单倍体分析，能计算OR和95%可信区间吗？ 我见别人的文章的能给出，如果能怎么计算，如果不能别人是怎么算出来的？文章理都没交代清楚
  • 邀请讨论

    • 不知道邀请谁？试试他们

    换一换
2013-03-30 08:28 浏览 : 2932 回复 : 7
  • 投票
  • 收藏 1
  • 打赏
  • 引用
  • 分享

    • 微信扫一扫

    • 新浪微博
    • 丁香客
    • 复制网址
  • 举报
    • 广告宣传推广
    • 政治敏感、违法虚假信息
    • 恶意灌水、重复发帖
    • 违规侵权、站友争执
    • 附件异常、链接失效
    • 其他
  • • 基层诊室的故事
wudaliming
wudaliming
丁香园准中级站友

  • 124
    积分
  • 860
    得票
  • 740
    丁当
  • 2楼
你用haplo.stats做过单倍型分析没？如果做过的话就会发现OR和95%置信区间和P值是一起计算出来的。haplo.stats是在R语言环境下操作的，楼主会操作R软件不？
2013-03-30 12:12
  • 投票
  • 收藏
  • 打赏
  • 引用
  • 分享

    • 微信扫一扫

    • 新浪微博
    • 丁香客
    • 复制网址
  • 举报
    • 广告宣传推广
    • 政治敏感、违法虚假信息
    • 恶意灌水、重复发帖
    • 违规侵权、站友争执
    • 附件异常、链接失效
    • 其他
  • • 00000
楼主 longjx12345
longjx12345
入门站友

  • 0
    积分
  • 10
    得票
  • 40
    丁当
  • 3楼
2013-03-31 09:39
  • 投票
  • 收藏
  • 打赏
  • 引用
  • 分享

    • 微信扫一扫

    • 新浪微博
    • 丁香客
    • 复制网址
  • 举报
    • 广告宣传推广
    • 政治敏感、违法虚假信息
    • 恶意灌水、重复发帖
    • 违规侵权、站友争执
    • 附件异常、链接失效
    • 其他
  • • 因疯狂敛财，哈尔滨第一医院原院长孟庆刚被开除党籍
楼主 longjx12345
longjx12345
入门站友

  • 0
    积分
  • 10
    得票
  • 40
    丁当
  • 4楼
我的只能算出分值和P值，用的是haplo.score，好像 haplo.cc是可以给出所有结果，但是不能校正性别年龄 haplo.cc命令为

cc.hla <- haplo.cc(y=Y01.vec,geno=Geno,miss.val=NA, locus.label=NA, control = haplo.glm.control(haplo.freq.min = 0.02))

cc.hla
haplo.score的命令为，可以校正性别年龄

Y01.hap.reg.FD <- haplo.score(y=Y01.vec,geno=Geno,trait.type="gaussian",miss.val=NA, locus.label=NA, x.adj=X.adj,skip.haplo)

Y01.hap.reg.FD

我想修改haplo.cc命令校正性别年龄，加了adj=X.adj, X.adj <- data.mat[,c(2:3)]已经赋值，但是出错了
cc.hla <- haplo.cc(y=Y01.vec,geno=Geno,miss.val=NA, locus.label=NA,x.adj=X.adj, control = haplo.glm.control(haplo.freq.min = 0.02))
错误于haplo.cc(y = Y01.vec, geno = Geno, miss.val = NA, locus.label = NA, :
变元((x.adj = X.adj)) 没有用
求高手帮我把haplo.cc命令改成可以校正性别年龄的，谢谢
2013-03-31 09:40
  • 投票
  • 收藏
  • 打赏
  • 引用
  • 分享

    • 微信扫一扫

    • 新浪微博
    • 丁香客
    • 复制网址
  • 举报
    • 广告宣传推广
    • 政治敏感、违法虚假信息
    • 恶意灌水、重复发帖
    • 违规侵权、站友争执
    • 附件异常、链接失效
    • 其他
longjx12345 编辑于 2013-03-31 10:10
  • • 放射医学中级考试真题回忆

关闭提示

需要2个丁当

丁香园旗下网站

  • 丁香园
  • 用药助手
  • 丁香通
  • 文献求助
  • 丁香人才
  • 丁香医生
  • 丁香导航
  • 丁香会议
  • 手机丁香园
  • 医药数据库

关于丁香园

  • 关于我们
  • 丁香园标志
  • 友情链接
  • 联系我们
  • 加盟丁香园
  • 版权声明
  • 资格证书

官方链接

  • 丁香志
  • 丁香园新浪微博
引用回复